BLASTN 2.2.3 [May-13-2002]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= BA0AB024B02LP1|AL428159
(1041 letters)
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
1807 sequences; 10,358,551 total letters
Searching....done
Score E
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>3x_Contig1790
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Strand = Plus / Plus
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>3x_Contig1773
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Score = 1915 bits (965), Expect = 0.0
Identities = 1024/1042 (98%), Gaps = 3/1042 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>3x_Contig1124
Length = 2635
Score = 1463 bits (737), Expect = 0.0
Identities = 762/769 (99%), Gaps = 1/769 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 272 cggcggtattagattatctatactgagcgaagtctaaatgacaatatataaaccgatcat 331
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Query: 512 tgtatatcaggtagcgtaggtgccaagcctttttctcaaaagatctacttcctccgatac 571
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Query: 572 atgttatcacgcgatgataattgctcaaacagaggctgtgggatcataaccaagaaatac 631
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Sbjct: 2155 tttattgttaaaggctccagaaaacatggattaagttgaattatgctcagcgacaagttc 2096
Query: 812 gcagtgcctaaaaaccaagcttgaggattatttcctccagagatcacgt-gtaccatgaa 870
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Sbjct: 2095 gcagtgcctaaaaaccaagcttgaggattatttcctccagagatcacgtagtaccatgaa 2036
Query: 871 aattaagtctaaaagctgaacacactttccccgcagcttcttccttcacttcaacattct 930
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Sbjct: 2035 aattaagtctaaaagctgaacacactttccccgcagcttcttccttcacttcaacattct 1976
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Query: 991 gcaaaaaagggaaaaagggaacgaaaataaacgctggactggtctgcat 1039
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Sbjct: 1915 gcaaaaaagggaaaaaggaaacgaaaataaacgctggactggtctgcat 1867
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
Posted date: Nov 27, 2002 12:23 PM
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Lambda K H
1.38 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.38 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
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Number of Sequences: 1807
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T: 0
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X2: 15 (29.8 bits)
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S2: 51 (101.7 bits)